Μοριακή ανίχνευση μεταλλαγών του γονιδίου c-KIT (c- KIT gene mutations)

Γενικές πληροφορίες

Το γονίδιο c-KIT είναι υπεύθυνο για την παραγωγή μιας πρωτεΐνης που βρίσκεται στην κυτταρική μεμβράνη ορισμένων τύπων κυττάρων και εμπλέκεται στη μεταγωγή σήματος σε αυτά. Οι οδοί σηματοδότησης που διεγείρονται από την συγκεκριμένη πρωτεΐνη ελέγχουν πολλές σημαντικές κυτταρικές διεργασίες, όπως η κυτταρική ανάπτυξη και διαίρεση, η επιβίωση και η μετανάστευση των κυττάρων. Τα σηματοδοτικά αυτά μονοπάτια είναι σημαντικά για την φυσιολογική ανάπτυξη και λειτουργία των γεννητικών κυττάρων, των αιμοποιητικών βλαστοκυττάρων, ενός τύπου λευκών αιμοσφαιρίων που ονομάζονται μαστοκύτταρα, των κυττάρων του γαστρεντερικού σωλήνα που ονομάζονται διάμεσα κύτταρα του Cajal και των μελανοκυττάρων.

Οι σωματικές μεταλλάξεις στο γονίδιο c-KIT έχουν συσχετιστεί με μια κακοήθεια του αίματος, την συστηματική μαστοκυττάρωση. Η νόσος αυτή συνήθως εμφανίζεται μετά την εφηβεία, ποικίλλει σε βαρύτητα και μπορεί να επηρεάσει πολλά διαφορετικά συστήματα του σώματος. Η συστηματική μαστοκυττάρωση εμφανίζεται όταν τα μαστοκύτταρα συσσωρεύονται ανώμαλα στους ιστούς. Τα κύτταρα αυτά φυσιολογικά παίζουν ρόλο στην ανοσολογική απόκριση του οργανισμού σε διάφορα ερεθίσματα καθώς και στην δημιουργία φλεγμονής κατά τη διάρκεια μιας αλλεργικής αντίδρασης.

Μια μετάλλαξη στο γονίδιο c-KIT (Asp816Val ή D816V) ανιχνεύεται σε περισσότερο από το 80% των ατόμων με συστηματική μαστοκυττάρωση. Αυτή και άλλες μεταλλάξεις του γονιδίου αυτού έχουν ως αποτέλεσμα την συσσώρευση μαστοκυττάρων στους ιστούς και την εμφάνιση των συμπτωμάτων της συστηματικής μαστοκυττάρωσης. Η περίσσεια των μαστοκυττάρων οδηγεί σε αυξημένη ανοσολογική απόκριση και σε συμπτώματα παρόμοια με αλλεργική αντίδραση, όπως ερυθρότητα του δέρματος, ναυτία, κοιλιακό άλγος, ρινική συμφόρηση, χαμηλή αρτηριακή πίεση και πονοκέφαλο.

Σωματικές μεταλλάξεις στο γονίδιο c-KIT έχουν εντοπιστεί και σε ορισμένες περιπτώσεις οξείας μυελογενούς λευχαιμίας καθώς και στο ρινικό λέμφωμα (sinonasal natural killer/T-cell lymphoma).

Μέθοδος

Πραγματοποιείται απομόνωση ολικού γενωμικού DNA και ακολουθεί εκλεκτικός πολλαπλασιασμός με PCR. Στη συνέχεια ακολουθεί Αλληλούχηση Νέας Γενιάς (Next Generation Sequencing, NGS) στην πλατφόρμα NGS ThermoFisher S5 και γίνεται ανάλυση του γονιδίου c-KIT.

Είδος δείγματος

Περιφερικό αίμα σε EDTA